(3)少し詳しく...

実行属性のついたファイルは /System/Executes の下に
シンボリックリンクが張られる 
(ここしか PATH が通っていない!)

ls -l /System/Executes/Vim

lrwxrwxrwx   1  gobo  gobo  14  Jun 30 vim  -> 
  /Programs/Vim/6.2/bin/vim

bzip2 で固めたバイナリパッケージがあり、依存関係も
見ている模様(Web によれば、ソースは make 推奨)